Коко никогда не должна была узнать правду. В её мире простым людям внушают, что магия - это дар, который передаётся по наследству, и никто из смертных не способен ей овладеть. Но однажды ночью она случайно видит, как странствующий маг Кифлий рисует в воздухе замысловатые знаки. И тут до неё доходит: магия - это не божественный дар, а искусство, и научиться ему может каждый, у кого есть инструменты и терпение. Вот только первая же попытка нарисовать заклинание оборачивается трагедией. Коко превращает свою мать и родной дом в камень. Спасает её только Кифлий, а затем забирает в своё ателье, чтобы она могла научиться управлять этой силой и, возможно, найти способ вернуть мать обратно.
Ателье оказывается не обычной школой, а тёплым, почти семейным местом, где вместе с Коко учатся и другие девочки. У каждой своя история: Агатта из богатой семьи сбежала от родителей, Тетя - молчаливая сирота, Рейша - талантливая и амбициозная. Им предстоит осваивать магию, которая требует не выкриков заклинаний и не взмахов палочки, а кропотливого рисования магических кругов особыми чернилами. Любая ошибка в линии - и заклинание может сработать не так или даже убить. Но за этой уютной и академичной атмосферой скрывается тревога. Кифлий явно что-то недоговаривает, в мире появляются опасные еретики, которые используют запретную магию, а сама Коко вскоре поймёт, что её появление в ателье - не случайность. Это аниме не про быстрые победы, а про тихую, вдумчивую историю о том, как трудно нести ответственность за свою силу и как легко ошибиться, даже желая добра.